El nombre original de Milpa Alta era Malacachtépec Momoxco , que significa "lugar rodeado de cerros donde hay túmulos funerarios". Sin embargo, con la llegada de los españoles y las tareas de evangelización, los frailes franciscanos decidieron rebautizar el poblado y con el tiempo, se desarrolló que el nombre oficial sería Milpa Alta, haciendo referencia a los campos donde se cultiva el maíz y otro tipo... de vegetales. Así mismo, las raíces prehispánicas no pudieron ser eliminadas del todo, ya que la palabra viene del náhuatl milpan , término con el que se le llama a cualquier campo cultivado.
